O Gabinete de Iniciativas Transfronteiriças é um projecto aprovado pelo Programa Operacional de Cooperação Transfronteiriça Espanha-Portugal (POCTEP) INTERREG V-A, e cofinanciado pela UE através do FEDER. Está estruturado em três núcleos, um em Mérida, dependente da Direção Geral de Ação Exterior da Junta da Extremadura, e os outros dois em Évora e Coimbra, tutelados, respectivamente, pelas Comissões de Coordenação e Desenvolvimento Regional do Alentejo e do Centro. Os três gabinetes contam com orçamentos e pessoal próprios e trabalham de modo coordenado para a consecução dos seus objectivos.
Entre as suas funções, está assegurar o funcionamento do Secretariado da Eurorregião, conforme estabelecido no Protocolo Constitutivo Comunidade de Trabalho EUROACE, e estimular todo o tipo de relações e projetos de cooperação entre Extremadura e Portugal.